13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3349 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3349  histone protein  100 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0680789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  30.6 
 
 		 1788 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  30.84 
 
 		 682 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2208  ribonuclease, Rne/Rng family protein  32.82 
 
 		 1065 aa  72  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1195  hypothetical protein  40.45 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0056  dehydrogenase subunit  34.38 
 
 		 524 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  50.75 
 
 		 248 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0053  hypothetical protein  37.21 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0301196 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  39.31 
 
 		 2397 aa  44.3  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3387  histone protein  73.91 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.990986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23860  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  34.11 
 
 		 1859 aa  42  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2944  histone protein  88.89 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>