19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2260 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2260  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  641    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1990  hypothetical protein  37.84 
 
 		 337 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0562007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3781  hypothetical protein  46.88 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185212  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  34.36 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1803  hypothetical protein  58.62 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000895551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3043  putative cointegrate resolution protein  35 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  30.67 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  32.56 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  32.5 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6443  hypothetical protein  26.69 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  31.97 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  32.5 
 
 		 349 aa  50.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3578  mucin-associated surface protein  40.91 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00254533  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6604  hypothetical protein  26.69 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  44.44 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5161  mucin-associated surface protein  46.67 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7283  hypothetical protein  30.04 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0877183  normal  0.0144014 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  32.1 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>