16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1805 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1805  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  454  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0148188  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2209  hypothetical protein  66.67 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2788  hypothetical protein  60.58 
 
 		 206 aa  175  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.322714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2278  hypothetical protein  60.58 
 
 		 206 aa  175  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3596  hypothetical protein  65.96 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3028  hypothetical protein  65.93 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2432  hypothetical protein  61.74 
 
 		 196 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0933223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4357  hypothetical protein  61.21 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1435  hypothetical protein  47.53 
 
 		 183 aa  141  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2710  putative signal peptide protein  52.04 
 
 		 146 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.122349 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1366  putative signal peptide protein  42.15 
 
 		 173 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2491  putative signal peptide protein  33.61 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2156  putative signal peptide protein  35.06 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2330  signal peptide protein  33.77 
 
 		 178 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2001  signal peptide protein  32.47 
 
 		 185 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1832  signal peptide protein  33.77 
 
 		 180 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830252  normal  0.442369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>