16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0589 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0589  acyltransferase 3  100 
 
 
363 aa  701    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4573  acyltransferase 3  47.41 
 
 
366 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0178  acyltransferase 3  49.56 
 
 
369 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3984  acyltransferase 3  45.78 
 
 
363 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487902  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3370  acyltransferase 3  44.32 
 
 
370 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365028  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0351  acyltransferase 3  36.62 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3139  acyltransferase 3  49.67 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.586381  normal  0.0112196 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2295  acyltransferase 3  43.96 
 
 
387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.976705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2806  acyltransferase 3  43.96 
 
 
387 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2122  acyltransferase 3  40.44 
 
 
367 aa  182  9.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2172  acyltransferase 3  43.52 
 
 
393 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219219  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2401  acyltransferase 3  43.56 
 
 
385 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0119  hypothetical protein  19.35 
 
 
383 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0158514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  22.73 
 
 
369 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  22.22 
 
 
369 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  26.02 
 
 
403 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>