23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0554 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0554  flagellar export FliJ  100 
 
 		 155 aa  313  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3803  flagellar export protein FliJ  50.68 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3077  flagellar export protein FliJ  50 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4391  flagellar export protein FliJ  42.14 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0642  flagellar export protein FliJ  45.7 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1117  flagellar export protein FliJ  37.14 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1572  flagellar biosynthesis chaperone  30.43 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.483296  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0162  flagellar FliJ protein  34.53 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3774  flagellar export protein FliJ  33.33 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.871006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2904  flagellar export protein FliJ  27.13 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2935  flagellar export protein FliJ  32.56 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3444  flagellar export protein FliJ  26.92 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1020  flagellar export protein FliJ  30.97 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5265  flagellar export protein FliJ  30.66 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206275 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1349  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  31.01 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550463  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5101  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  31.25 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371011  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1876  flagellar export protein FliJ  31.16 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.290695  normal  0.367197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0569  flagellar biosynthesis chaperone  31.58 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4266  flagellar biosynthesis chaperone  27.41 
 
 		 147 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314958  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3087  flagellar export protein FliJ  31.06 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0724627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24190  flagellar export protein  27.45 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00386348  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50080  flagellar biosynthesis chaperone  26.87 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0139652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2821  flagellar biosynthesis chaperone  22.46 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0229803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>