13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0533 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0533  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  324  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0765  hypothetical protein  47.71 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.399241  normal  0.0717965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1320  hypothetical protein  40.29 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1082  hypothetical protein  47.67 
 
 		 211 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0676  hypothetical protein  51.06 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0344722  normal  0.330047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0655  hypothetical protein  51.06 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0132157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5688  hypothetical protein  48.53 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0188515  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3127  general secretion pathway protein C  52.31 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0752343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3674  hypothetical protein  36.62 
 
 		 224 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0926  hypothetical protein  38.26 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0152413  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3418  general secretion pathway protein C  31.75 
 
 		 195 aa  47.8  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000246918 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3218  hypothetical protein  32.79 
 
 		 229 aa  41.2  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3381  hypothetical protein  31.67 
 
 		 204 aa  41.2  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>