61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3809 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3809  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0487  hypothetical protein  37.82 
 
 		 189 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0203  putative signal peptide protein  47.9 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2825  hypothetical protein  36.27 
 
 		 189 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2814  hypothetical protein  36.27 
 
 		 189 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2874  hypothetical protein  38.22 
 
 		 189 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2200  hypothetical protein  36.27 
 
 		 189 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.185923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2732  hypothetical protein  38.22 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6144  hypothetical protein  36.27 
 
 		 189 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0302  hypothetical protein  37.7 
 
 		 199 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5424  hypothetical protein  36.6 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0346  hypothetical protein  46.88 
 
 		 188 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22064  hitchhiker  0.000122714 
 
 
-
 
NC_003296  RS03145  signal peptide protein  40.6 
 
 		 187 aa  92.4  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.561242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1159  hypothetical protein  47.01 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0457  hypothetical protein  34.59 
 
 		 189 aa  88.6  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4028  signal peptide protein  33.15 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0549  hypothetical protein  35.33 
 
 		 181 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2911  hypothetical protein  35.14 
 
 		 181 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0732  hypothetical protein  35.14 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203793  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0565  hypothetical protein  35.33 
 
 		 181 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1482  hypothetical protein  35.14 
 
 		 181 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.553331  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0106  hypothetical protein  35.14 
 
 		 181 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3136  hypothetical protein  35.14 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396711  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0023  hypothetical protein  37.59 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4180  putative signal peptide protein  41.53 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0328239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0022  hypothetical protein  45.26 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4292  signal peptide protein  41.53 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0571  hypothetical protein  34.57 
 
 		 187 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.00795396 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0006  hypothetical protein  44.54 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0010  hypothetical protein  52.44 
 
 		 191 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0024  hypothetical protein  44.54 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4145  hypothetical protein  43.4 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0993  hypothetical protein  33.97 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.262375  normal  0.178793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0849  hypothetical protein  33.97 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.0957945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1064  hypothetical protein  34.08 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0953  hypothetical protein  44.68 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5636  hypothetical protein  44.68 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1324  hypothetical protein  32.8 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.232671  normal  0.60591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0765  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0737  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5310  Lipid A 3-O-deacylase  33.8 
 
 		 173 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0778  hypothetical protein  32.69 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61650  Lipid A 3-O-deacylase  34.51 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0713933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4452  hypothetical protein  33.58 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01920  lipidA 3-O-deacylase  37.89 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4744  hypothetical protein  33.56 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179642  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3154  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0288324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2560  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0942  hypothetical protein  24.48 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0424238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3668  hypothetical protein  25.79 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000166039  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2892  hypothetical protein  30.56 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2700  hypothetical protein  29.86 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00035  hypothetical protein  30.33 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0504  hypothetical protein  35.11 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2429  hypothetical protein  32.91 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.53459  normal  0.40349 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2484  hypothetical protein  32.91 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.495338  normal  0.030402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2470  putative outer membrane protein  32.91 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.283887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2380  putative outer membrane protein  32.91 
 
 		 185 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.19126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2587  putative outer membrane protein  31.65 
 
 		 185 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0924166 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0161  hypothetical protein  31.82 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1000  hypothetical protein  47.92 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0163716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>