56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1064 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1064  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  350  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4452  hypothetical protein  74.42 
 
 		 172 aa  264  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0778  hypothetical protein  74.42 
 
 		 175 aa  263  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0737  hypothetical protein  73.84 
 
 		 175 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0765  hypothetical protein  77.12 
 
 		 154 aa  250  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4744  hypothetical protein  67.26 
 
 		 172 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179642  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0953  hypothetical protein  62.21 
 
 		 172 aa  230  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5310  Lipid A 3-O-deacylase  65.88 
 
 		 173 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61650  Lipid A 3-O-deacylase  64.71 
 
 		 173 aa  217  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0713933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5636  hypothetical protein  67.41 
 
 		 135 aa  201  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3154  hypothetical protein  57.24 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0288324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2560  hypothetical protein  57.24 
 
 		 173 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2892  hypothetical protein  58.94 
 
 		 173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2700  hypothetical protein  58.28 
 
 		 173 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01920  lipidA 3-O-deacylase  50.85 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1324  hypothetical protein  52.66 
 
 		 169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.232671  normal  0.60591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3809  hypothetical protein  34.08 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0849  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.0957945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0993  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.262375  normal  0.178793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3020  hypothetical protein  35.58 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.149261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0504  hypothetical protein  26.67 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00035  hypothetical protein  31.4 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3668  hypothetical protein  28.8 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000166039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0203  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0942  hypothetical protein  33.61 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0424238  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5424  hypothetical protein  34.46 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4145  hypothetical protein  27.78 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0346  hypothetical protein  32.61 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22064  hitchhiker  0.000122714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0571  hypothetical protein  28.33 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.00795396 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0302  hypothetical protein  26.44 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03145  signal peptide protein  33.04 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.561242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0487  hypothetical protein  32.17 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2874  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0457  hypothetical protein  30.6 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6144  hypothetical protein  31.58 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4180  putative signal peptide protein  27.44 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0328239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4292  signal peptide protein  27.44 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1482  hypothetical protein  33.04 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.553331  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2911  hypothetical protein  33.04 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0565  hypothetical protein  33.04 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0549  hypothetical protein  33.04 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0106  hypothetical protein  33.04 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0732  hypothetical protein  33.04 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3136  hypothetical protein  33.04 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2814  hypothetical protein  31.58 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2200  hypothetical protein  31.58 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.185923  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2825  hypothetical protein  31.58 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0023  hypothetical protein  30.22 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1159  hypothetical protein  31.36 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4028  signal peptide protein  26.63 
 
 		 208 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0024  hypothetical protein  29.58 
 
 		 201 aa  52  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0006  hypothetical protein  29.58 
 
 		 201 aa  52  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0010  hypothetical protein  29.51 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0022  hypothetical protein  28.69 
 
 		 220 aa  48.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0161  hypothetical protein  28.06 
 
 		 224 aa  47.8  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>