19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1000 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1000  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  362  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0163716  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0258  hypothetical protein  44.52 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0435  hypothetical protein  44.52 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.339037  hitchhiker  0.000000587691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1831  hypothetical protein  45.91 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1506  hypothetical protein  45.91 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2472  hypothetical protein  37.84 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.370601  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3081  hypothetical protein  36.62 
 
 		 203 aa  87  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4744  hypothetical protein  43.64 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179642  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0223  hypothetical protein  41.82 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1159  hypothetical protein  34.92 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02526  hypothetical protein  31.85 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.682483  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3809  hypothetical protein  47.92 
 
 		 236 aa  44.3  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1379  hypothetical protein  48.89 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147671  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0737  hypothetical protein  41.07 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0765  hypothetical protein  41.07 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0778  hypothetical protein  41.07 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4452  hypothetical protein  41.07 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0953  hypothetical protein  34.55 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5310  Lipid A 3-O-deacylase  38.6 
 
 		 173 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>