15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2369 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2369  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 596 aa  1222    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0658  C-5 cytosine-specific DNA methylase  53.88 
 
 		 648 aa  654    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.538294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2374  C-5 cytosine-specific DNA methylase  65.66 
 
 		 636 aa  785    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0270809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1185  C-5 cytosine-specific DNA methylase  63.22 
 
 		 559 aa  733    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00256863  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2352  C-5 cytosine-specific DNA methylase  71.36 
 
 		 559 aa  837    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1720  C-5 cytosine-specific DNA methylase  62.29 
 
 		 434 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000451649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2937  C-5 cytosine-specific DNA methylase  59.88 
 
 		 692 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1717  C-5 cytosine-specific DNA methylase  77.95 
 
 		 135 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1093  C-5 cytosine-specific DNA methylase  77.23 
 
 		 107 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00117815  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1573  C-5 cytosine-specific DNA methylase  77.23 
 
 		 107 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00203711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2452  hypothetical protein  48.2 
 
 		 177 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000760235  unclonable  0.000000000305739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  28.35 
 
 		 358 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  23.7 
 
 		 375 aa  45.8  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  26.09 
 
 		 371 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  31.31 
 
 		 374 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>