19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_R0029 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_R0029  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0041  tRNA-Ser  96.7 
 
 		 91 bp  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0038  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0014  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01890  tRNA-Ser  87.27 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.961125 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.582524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0042  tRNA-Ser  84.27 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0252019 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0005  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14041  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.197809 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0034  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.285204  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0026  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0044  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0032  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0012  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0470905  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0052  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.407966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0005  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0827616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>