10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0005 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0016  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  MSED_t10  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 109 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.236115 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0002  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 96 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000357273  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0041  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0029  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0026  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0007  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.715121  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0003  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 96 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.466331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>