20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3209 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3209  hypothetical protein  100 
 
 		 1143 aa  2233    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0782308  normal  0.555781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3908  hypothetical protein  71.58 
 
 		 806 aa  622  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0160  hypothetical protein  40.26 
 
 		 722 aa  242  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.323521  normal  0.0311876 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0517  hypothetical protein  34.41 
 
 		 1048 aa  82.8  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0493  hypothetical protein  34.41 
 
 		 1048 aa  82.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  24.35 
 
 		 1112 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2825  hypothetical protein  30.22 
 
 		 942 aa  52  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  24.75 
 
 		 1070 aa  49.7  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  24.75 
 
 		 1070 aa  49.7  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2909  hypothetical protein  30.85 
 
 		 656 aa  48.9  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0214301  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0498  VirB6 family type IV secretion system protein  18.8 
 
 		 1468 aa  46.2  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1201  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 677 aa  45.8  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0532149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  28.14 
 
 		 734 aa  45.8  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 686 aa  45.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3763  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  45.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3250  CG2839  35.8 
 
 		 231 aa  45.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1372  phage-related tail fiber protein  33.81 
 
 		 762 aa  45.1  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0371  IcmE  25.59 
 
 		 1039 aa  45.1  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4225  hypothetical protein  32.5 
 
 		 734 aa  44.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0726611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  26.39 
 
 		 330 aa  44.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>