17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1201 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1201  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 677 aa  1395    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0532149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0930  hypothetical protein  26.13 
 
 		 629 aa  127  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.503451  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2454  hypothetical protein  26.48 
 
 		 600 aa  123  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0387  hypothetical protein  21.57 
 
 		 595 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0396  hypothetical protein  21.41 
 
 		 595 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.807659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70572  Phospho Mannno Transferase; dolichyl-P-mannose-protein mannosyltransferase  25.5 
 
 		 759 aa  55.1  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0562818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 824 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 609 aa  50.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 767 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  25.54 
 
 		 465 aa  48.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3209  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1143 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0782308  normal  0.555781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.54 
 
 		 293 aa  45.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 810 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  43.86 
 
 		 1737 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  43.64 
 
 		 878 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  46.81 
 
 		 750 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3497  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 178 aa  44.3  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>