14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2606 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2606  metallophosphoesterase  100 
 
 
277 aa  573  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2872  metallophosphoesterase  86.19 
 
 
292 aa  490  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0687  metallophosphoesterase  25.76 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2463  hypothetical protein  26 
 
 
275 aa  58.9  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2512  hypothetical protein  26 
 
 
275 aa  58.9  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2016  hypothetical protein  23.77 
 
 
269 aa  55.8  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00320612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  24.62 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4056  metallophosphoesterase  25.1 
 
 
236 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2453  hypothetical protein  25.64 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  33.6 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  30 
 
 
425 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  26.76 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1056  phosphohydrolase  25 
 
 
295 aa  43.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  24.27 
 
 
281 aa  42.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>