12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2491 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2713  hypothetical protein  71.59 
 
 
672 aa  741    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0108305  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2491  hypothetical protein  100 
 
 
543 aa  1079    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1851  hypothetical protein  37.73 
 
 
642 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4269  hypothetical protein  28.18 
 
 
678 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0936509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3885  hypothetical protein  28.34 
 
 
765 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.848527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0854  hypothetical protein  28.11 
 
 
765 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5033  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0884  hypothetical protein  27.21 
 
 
795 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.293077  normal  0.0770667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2705  hypothetical protein  23.52 
 
 
653 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4347  hypothetical protein  23.08 
 
 
630 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3818  hypothetical protein  24.65 
 
 
640 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00672536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1618  hypothetical protein  23.73 
 
 
755 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1331  hypothetical protein  24.4 
 
 
751 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.870036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>