16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1435 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1435  ribosomal protein L35  100 
 
 		 67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1033  ribosomal protein L35  94.03 
 
 		 70 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.753254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0767  ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0679  50S ribosomal protein L35  44.26 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000758197  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0751  50S ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000137261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_657  ribosomal protein L35  40.98 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000644452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  44.83 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  37.1 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  32.26 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3162  hypothetical protein  42.62 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  37.93 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  44.07 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  37.7 
 
 		 79 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>