66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1082 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1082  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  659    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  87.27 
 
 		 322 aa  547  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3215  protein of unknown function DUF95 transmembrane  52.05 
 
 		 331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0604768  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4267  hypothetical protein  47.99 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000574123  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  33.13 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2278  protein of unknown function DUF95 transmembrane  35.08 
 
 		 320 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4440  integral membrane protein  33.94 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.627062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3743  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.01 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3128  protein of unknown function DUF95 transmembrane  34.97 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5852  hypothetical protein  31.65 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0756  hypothetical protein  32.49 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5458  hypothetical protein  29.91 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4888  hypothetical protein  33.64 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.32174  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1334  hypothetical protein  29.25 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3317  hypothetical protein  33.64 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56110  hypothetical protein  33.03 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20720  uncharacterized membrane protein  30.96 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04898  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2502  putative integral membrane protein  29.85 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3912  integral membrane protein  28.22 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00542014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38340  hypothetical protein  34.63 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2676  hypothetical protein  30.09 
 
 		 333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4823  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.59 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0410  hypothetical protein  31.41 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4022  integral membrane protein  33.04 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96338  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.66 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3844  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.77 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1404  membrane protein-like protein  26.73 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09283  hypothetical protein  27.03 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2967  hypothetical protein  31.27 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal  0.0170262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1202  integral membrane protein  28.04 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.525523  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2133  hypothetical protein  25.52 
 
 		 603 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.82 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4318  integral membrane protein  33.33 
 
 		 326 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7600  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.04 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0773481  normal  0.0891448 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2521  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.05 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.626612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4951  hypothetical protein  29.01 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4862  hypothetical protein  29.01 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5230  hypothetical protein  29.01 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.753806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09270  uncharacterized membrane protein  26.96 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.130747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0462  hypothetical protein  32.03 
 
 		 356 aa  99.8  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4959  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.06 
 
 		 315 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000637265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  27.95 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13725  transmembrane protein  28.66 
 
 		 330 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258744  normal  0.61477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1272  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.81 
 
 		 328 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000243278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3752  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.89 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3829  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.33 
 
 		 332 aa  92.8  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157843  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2338  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.18 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00579329  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2232  hypothetical protein  22.22 
 
 		 324 aa  89.4  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1835  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.65 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.920974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3575  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.14 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1683  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.77 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  35.16 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0346  protein of unknown function DUF95 transmembrane  38.84 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.160239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1962  hypothetical protein  28.35 
 
 		 197 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.923141 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1030  hypothetical protein  29.28 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  36.36 
 
 		 509 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0144  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.75 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1427  protein of unknown function DUF95 transmembrane  36.13 
 
 		 511 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0209  hypothetical protein  32.28 
 
 		 176 aa  46.6  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0691804  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0524  hypothetical protein  24.19 
 
 		 181 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.202307  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1789  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.82 
 
 		 754 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.482085 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1138  hypothetical protein  27.17 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1854  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.79 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0828  hypothetical protein  36.54 
 
 		 189 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0535  hypothetical protein  26.5 
 
 		 160 aa  43.1  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0049  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.08 
 
 		 191 aa  42.7  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000020033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>