13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3202 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3202  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.147493 
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  76.47 
 
 		 492 aa  332  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  29.6 
 
 		 481 aa  62.4  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  27.56 
 
 		 514 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  27.08 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  28.18 
 
 		 490 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  26.58 
 
 		 647 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  28.89 
 
 		 514 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  28.89 
 
 		 514 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  28.89 
 
 		 514 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  28.89 
 
 		 513 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  28.33 
 
 		 514 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  35.48 
 
 		 493 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>