12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1919 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1919  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  316  7.999999999999999e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.795239 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00192  predicted lipoprotein  28.1 
 
 		 274 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3409  putative lipoprotein  28.1 
 
 		 274 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.280646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0197  hypothetical protein  28.1 
 
 		 274 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3466  hypothetical protein  28.1 
 
 		 274 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310115  normal  0.308397 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0187  hypothetical protein  28.1 
 
 		 274 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.656358  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00191  hypothetical protein  28.1 
 
 		 274 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.398851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0205  hypothetical protein  27.45 
 
 		 274 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0204  hypothetical protein  26.8 
 
 		 274 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0504389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3538  hypothetical protein  28.4 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2404  protein of unknown function DUF1105  27.67 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1542  hypothetical protein  25 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>