49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1694 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1694  phage HK022 GP18-like protein  100 
 
 		 233 aa  477  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235763  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1059  phage minor tail protein L  62.83 
 
 		 227 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1691  phage minor tail protein L  62.39 
 
 		 227 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3879  phage minor tail protein L  59.29 
 
 		 227 aa  279  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.533723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08260  putative minor tail protein L  56.47 
 
 		 231 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0782  phage minor tail protein L  56.03 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2223  phage minor tail protein L  45.85 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.915953 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3099  phage minor tail protein L  47.41 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.221958  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0091  phage minor tail protein L  50.21 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2384  phage minor tail protein L  46.22 
 
 		 250 aa  221  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2579  phage minor tail protein L  45.68 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3385  phage minor tail protein L  48.32 
 
 		 232 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126204  hitchhiker  0.0000000000973019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2778  Phage minor tail protein L  46.8 
 
 		 249 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0268125  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2949  prophage LambdaSo, minor tail protein L  44.03 
 
 		 241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2419  phage minor tail protein L  44 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172101  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3931  phage minor tail protein L  44 
 
 		 249 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0446  phage minor tail protein  39.26 
 
 		 272 aa  191  8e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0661  phage minor tail protein L  38.12 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000371871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1200  phage minor tail protein L  38.81 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764966 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10051  tail component  38.22 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00747  hypothetical protein  38.22 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2106  phage minor tail protein L  38.22 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000127326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1635  phage minor tail protein L  38.22 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1469  phage minor tail protein L  38.22 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0910  phage minor tail protein L  38.74 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3192  phage minor tail protein L  38.81 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000040598 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1874  phage minor tail protein L  38.81 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.108794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2766  phage minor tail protein L  37.9 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.863753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1798  phage minor tail protein L  37.9 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0535424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1197  phage minor tail protein L  37.9 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2171  phage minor tail protein L  38.25 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3124  phage minor tail protein L  38.36 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0393909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1551  phage minor tail protein L  37.9 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120682  hitchhiker  0.00403336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0705  phage minor tail protein L  37.44 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018525 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0883  phage minor tail protein L  37.79 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2799  phage minor tail protein L  37.44 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145975  normal  0.513546 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1090  phage minor tail protein L  37.44 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.555696  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1083  phage minor tail protein L  33.63 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1420  phage minor tail protein L  32.75 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0336216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1155  phage minor tail protein L  32.75 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3879  phage minor tail protein L  33.61 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5753  phage minor tail protein L  33.76 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7021  phage minor tail protein L  33.61 
 
 		 243 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6225  phage minor tail protein L  33.05 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3530  phage minor tail protein L  33.76 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5050  phage minor tail protein L  33.33 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4060  phage minor tail protein L  32.91 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2235  minor tail protein  37.74 
 
 		 145 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000108379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1891  Phage-related protein-like  25.71 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0777557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>