14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0621 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0621  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  163  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  56.82 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  50 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  48.72 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  49.37 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1517  hypothetical protein  48.31 
 
 		 86 aa  50.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1323  pyruvate kinase  45.24 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  47.5 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  44.09 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  50 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  48.24 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  53.85 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  46.59 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2570  pentapeptide MXKDX repeat protein  46.67 
 
 		 94 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>