22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2763 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2763  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3610  hypothetical protein  70.89 
 
 
82 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754019  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6975  protein of unknown function DUF497  67.09 
 
 
81 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0975  hypothetical protein  62.5 
 
 
106 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.024485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3499  hypothetical protein  55.7 
 
 
83 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41867  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3176  hypothetical protein  55.84 
 
 
85 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000790904  normal  0.0520266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1533  hypothetical protein  54.88 
 
 
86 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0338  hypothetical protein  50.57 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0616  hypothetical protein  49.23 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.173694  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0417  protein of unknown function DUF497  43.42 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31950  hypothetical protein  38.55 
 
 
89 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4530  hypothetical protein  34.62 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1380  hypothetical protein  34.62 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0092  hypothetical protein  34.57 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1969  protein of unknown function DUF497  37.8 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3087  protein of unknown function DUF497  32.93 
 
 
92 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3033  protein of unknown function DUF497  32.93 
 
 
92 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.692737  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1315  protein of unknown function DUF497  31.76 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162456 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1996  protein of unknown function DUF497  36.59 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80933  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2638  hypothetical protein  38.2 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.619924 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1807  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.729301  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3634  hypothetical protein  30.77 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>