33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1988 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1988  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  215  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.480942  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0698  hypothetical protein  98.25 
 
 		 114 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1975  hypothetical protein  58.25 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.152581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2138  hypothetical protein  30.93 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.258224 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0420  conserved hypothetical protein  33.62 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.698705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03095  hypothetical protein  33.62 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4615  hypothetical protein  33.62 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00242276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0420  hypothetical protein  33.62 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0418583  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3776  hypothetical protein  33.62 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0228231  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3487  hypothetical protein  33.62 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0132445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03144  hypothetical protein  33.62 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3588  hypothetical protein  32.76 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.176782  normal  0.0999018 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3679  hypothetical protein  33.62 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2022  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0357  hypothetical protein  33.66 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0621  hypothetical protein  28.24 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3794  hypothetical protein  30.39 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0386  hypothetical protein  27.62 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0360  hypothetical protein  27.62 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1425  hypothetical protein  32.91 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0363  hypothetical protein  27.62 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0372  hypothetical protein  27.62 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0167  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0429  hypothetical protein  27.62 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0374  hypothetical protein  28.3 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1547  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0712336  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3609  hypothetical protein  29.41 
 
 		 122 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.377178 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3608  hypothetical protein  29.41 
 
 		 122 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0444844  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3779  hypothetical protein  29.41 
 
 		 122 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.496691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3716  hypothetical protein  29.41 
 
 		 122 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.382925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3681  hypothetical protein  29.41 
 
 		 122 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2030  hypothetical protein  28.57 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000204387  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1157  hypothetical protein  30.38 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>