More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3921 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1805  elongation factor G  80.15 
 
 		 655 aa  1084    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.504417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2978  elongation factor G  76.72 
 
 		 696 aa  1098    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.493994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1140  elongation factor G  49.63 
 
 		 671 aa  649    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1300  elongation factor G  92.3 
 
 		 688 aa  1286    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5941  elongation factor G  57.87 
 
 		 678 aa  768    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130672  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4119  elongation factor G  83.31 
 
 		 682 aa  1165    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4806  elongation factor G  89.75 
 
 		 683 aa  1263    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3921  elongation factor G  100 
 
 		 683 aa  1375    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1106  elongation factor G  77.97 
 
 		 699 aa  1119    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5234  elongation factor G  57.42 
 
 		 678 aa  761    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2110  elongation factor G  56.74 
 
 		 671 aa  739    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2771  elongation factor G  46.43 
 
 		 688 aa  615  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252482  normal  0.08809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1634  elongation factor G  47.23 
 
 		 675 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3762  elongation factor G  46.33 
 
 		 681 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0675022 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0922  elongation factor G  47.34 
 
 		 667 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122297  normal  0.0871733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2247  elongation factor G  47.34 
 
 		 669 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.040202  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2248  elongation factor G  47.05 
 
 		 670 aa  591  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.456219 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1365  elongation factor G  46.1 
 
 		 678 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0359186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3294  elongation factor G  46.04 
 
 		 680 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1336  elongation factor G  45.95 
 
 		 678 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0279  small GTP-binding protein  45.16 
 
 		 676 aa  563  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1277  elongation factor G  47.06 
 
 		 686 aa  556  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836232  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1818  elongation factor G  44.82 
 
 		 642 aa  538  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237158 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2082  elongation factor G  46.36 
 
 		 662 aa  522  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0399925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0543  elongation factor G  43.35 
 
 		 660 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2751  elongation factor G  43.37 
 
 		 661 aa  487  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4086  elongation factor G  38.58 
 
 		 653 aa  412  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5899  elongation factor G  37.48 
 
 		 653 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  35.2 
 
 		 673 aa  362  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  34.29 
 
 		 692 aa  362  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  32.25 
 
 		 688 aa  361  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  32.67 
 
 		 695 aa  360  5e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.3 
 
 		 692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  32.5 
 
 		 701 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  33.09 
 
 		 700 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1083  translation elongation factor G  33 
 
 		 699 aa  353  8.999999999999999e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488496  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  31.73 
 
 		 695 aa  352  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  32.8 
 
 		 691 aa  351  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  33.28 
 
 		 686 aa  350  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  30.39 
 
 		 696 aa  349  8e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  32.94 
 
 		 701 aa  349  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  33.29 
 
 		 704 aa  348  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  32.07 
 
 		 692 aa  348  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  32.7 
 
 		 694 aa  346  8e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  33.77 
 
 		 688 aa  345  1e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  33.04 
 
 		 691 aa  346  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  32.51 
 
 		 689 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  34.63 
 
 		 691 aa  345  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  34.28 
 
 		 680 aa  344  2.9999999999999997e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  32.81 
 
 		 692 aa  344  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  31.79 
 
 		 679 aa  343  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  33.14 
 
 		 692 aa  343  7e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  33.09 
 
 		 673 aa  343  9e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  33.04 
 
 		 682 aa  342  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  32.35 
 
 		 692 aa  342  2e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  33.38 
 
 		 696 aa  341  2e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  33.24 
 
 		 689 aa  341  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  32.94 
 
 		 690 aa  341  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  32.81 
 
 		 692 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  33.14 
 
 		 688 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  32.23 
 
 		 692 aa  340  4e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  32.94 
 
 		 697 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  33.43 
 
 		 701 aa  340  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  31.63 
 
 		 692 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  31.94 
 
 		 692 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  32.75 
 
 		 696 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  32.9 
 
 		 689 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  32.14 
 
 		 692 aa  338  1.9999999999999998e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  31.62 
 
 		 692 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  31.62 
 
 		 692 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  31.62 
 
 		 692 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  31.62 
 
 		 692 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  32.04 
 
 		 682 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  31.62 
 
 		 692 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  32.17 
 
 		 692 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  31.2 
 
 		 697 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  31.62 
 
 		 692 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  32.01 
 
 		 689 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  32.95 
 
 		 692 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  31.86 
 
 		 692 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  30.73 
 
 		 693 aa  337  5e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  31.47 
 
 		 692 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  31.44 
 
 		 696 aa  337  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  34.42 
 
 		 656 aa  336  7e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  32.42 
 
 		 703 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  31.47 
 
 		 692 aa  336  9e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  30.61 
 
 		 694 aa  336  9e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  33 
 
 		 689 aa  335  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  32.71 
 
 		 696 aa  335  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  33.38 
 
 		 704 aa  333  4e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  32.08 
 
 		 692 aa  333  7.000000000000001e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  33.38 
 
 		 704 aa  333  8e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  32.23 
 
 		 691 aa  333  8e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  32.41 
 
 		 695 aa  332  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  33.86 
 
 		 698 aa  332  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  35.79 
 
 		 701 aa  332  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  32.83 
 
 		 670 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  32.36 
 
 		 691 aa  331  3e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  34.67 
 
 		 708 aa  331  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  32.71 
 
 		 691 aa  331  3e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>