11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2833 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2833  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 82 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0990376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2803  hypothetical protein  90.24 
 
 		 100 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3242  type IV pilus assembly PilZ  84.15 
 
 		 82 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.439074  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  43.14 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  35.48 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  37.04 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  42.31 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2135  hypothetical protein  30 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4372  type IV pilus assembly PilZ  39.62 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  30.23 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2644  hypothetical protein  30.16 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>