26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4328 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4328  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  256  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1127  hypothetical protein  81.4 
 
 		 129 aa  219  9e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  0.694402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1260  hypothetical protein  78.4 
 
 		 125 aa  216  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357949  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1242  hypothetical protein  82.17 
 
 		 129 aa  214  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4016  hypothetical protein  79.2 
 
 		 125 aa  214  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2701  hypothetical protein  75.2 
 
 		 163 aa  204  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0364226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2380  hypothetical protein  87.38 
 
 		 146 aa  197  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.37673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1477  hypothetical protein  58.82 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2615  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0733143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0962  hypothetical protein  44.26 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0665  hypothetical protein  45.61 
 
 		 111 aa  110  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0671  hypothetical protein  46.73 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1168  hypothetical protein  46.46 
 
 		 140 aa  103  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1016  hypothetical protein  47.47 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.586424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4669  hypothetical protein  44.21 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1064  hypothetical protein  46 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.589479  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4300  hypothetical protein  44.21 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3985  hypothetical protein  47 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  decreased coverage  0.00103127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4818  hypothetical protein  44.21 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  0.143523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1090  hypothetical protein  44.44 
 
 		 229 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2096  hypothetical protein  44.21 
 
 		 146 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0697301  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0715  hypothetical protein  45.36 
 
 		 214 aa  88.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0709  putative signal peptide protein  44.55 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1465  hypothetical protein  38.61 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0757  hypothetical protein  37.36 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0823  hypothetical protein  40.82 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32462  hitchhiker  0.000215418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>