20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3964 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3964  cupin 2, barrel  100 
 
 		 95 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0415147  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1420  cupin 2, barrel  75.53 
 
 		 95 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.809174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1440  hypothetical protein  74.47 
 
 		 95 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4658  hypothetical protein  71.28 
 
 		 95 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6852  hypothetical protein  79.45 
 
 		 73 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.286237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01610  hypothetical protein  52.33 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522727  normal  0.697897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0207  hypothetical protein  51.16 
 
 		 95 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4250  hypothetical protein  51.16 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.41432  normal  0.497138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0412  hypothetical protein  47.25 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1619  hypothetical protein  45.35 
 
 		 99 aa  87.8  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7511  hypothetical protein  45.24 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1128  hypothetical protein  43.18 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1491  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.68 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3900  cupin 2 domain-containing protein  42.53 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.487212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0685  cupin 2 domain-containing protein  43.68 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.419495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2708  cupin 2 protein  40.48 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4900  hypothetical protein  31.52 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3881  hypothetical protein  31.11 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4272  hypothetical protein  31.11 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0273731  hitchhiker  0.00830783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3912  hypothetical protein  31.18 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243532  normal  0.0732889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>