10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3066 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3066  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0460582  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.56 
 
 		 557 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0811  N/apple PAN precursor protein  38.24 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4596  apple PAN precursor  36.76 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0899966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0251  hypothetical protein  34.34 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0731  apple domain-containing protein  40.38 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33044  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0005  hypothetical protein  36.76 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0891  Apple  35.71 
 
 		 183 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0821  hypothetical protein  35.44 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.663641 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0913  hypothetical protein  34.62 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0331786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>