More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2007 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2479  phosphate acetyltransferase  48.17 
 
 
714 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2567  phosphate acetyltransferase  48.17 
 
 
714 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3317  phosphate acetyltransferase  48.61 
 
 
729 aa  644    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000353028  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2113  phosphate acetyltransferase  49.1 
 
 
723 aa  665    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.330408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1169  phosphate acetyltransferase  48.64 
 
 
696 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957465  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1550  phosphate acetyltransferase  48.18 
 
 
717 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4685  phosphate acetyltransferase  51.93 
 
 
704 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.633207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1007  phosphate acetyltransferase  49.21 
 
 
696 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2687  phosphate acetyltransferase  48.17 
 
 
714 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0615  phosphate acetyltransferase  48.53 
 
 
714 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2579  phosphate acetyltransferase  48.17 
 
 
714 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1442  phosphate acetyltransferase  48.18 
 
 
717 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2997  phosphate acetyltransferase  60 
 
 
703 aa  787    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  52.74 
 
 
697 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0262  phosphate acetyltransferase  54.11 
 
 
683 aa  660    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0643  phosphate acetyltransferase  54.95 
 
 
687 aa  687    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0834  phosphate acetyltransferase  94.89 
 
 
715 aa  1225    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.239036  normal  0.0501662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1079  phosphate acetyltransferase  94.78 
 
 
716 aa  1229    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2007  phosphate acetyltransferase  100 
 
 
711 aa  1400    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1384  phosphate acetyltransferase  49.58 
 
 
713 aa  651    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000919072  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2410  phosphate acetyltransferase  47.42 
 
 
726 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000273305  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0051  phosphate acetyltransferase  53.97 
 
 
703 aa  680    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0802  phosphate acetyltransferase  47.4 
 
 
712 aa  637    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53480  phosphate acetyltransferase  51.71 
 
 
704 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014166 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1483  phosphate acetyltransferase  49.79 
 
 
712 aa  655    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0111622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2524  phosphate acetyltransferase  48.17 
 
 
714 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.451087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2841  phosphate acetyltransferase  47.83 
 
 
713 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.384349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34550  phosphate acetyltransferase  50.35 
 
 
712 aa  638    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2560  phosphate acetyltransferase  49.08 
 
 
713 aa  663    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00240878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2781  phosphate acetyltransferase  49.79 
 
 
712 aa  655    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000660033  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3312  phosphate acetyltransferase  49.65 
 
 
720 aa  651    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1132  phosphate acetyltransferase  51.19 
 
 
717 aa  670    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02222  phosphate acetyltransferase  47.64 
 
 
714 aa  633  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.02628  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1359  phosphate acetyltransferase  47.64 
 
 
714 aa  633  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752177  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002967  phosphate acetyltransferase  47.63 
 
 
714 aa  634  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.596051  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2673  phosphate acetyltransferase  47.64 
 
 
714 aa  633  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0331712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3437  phosphate acetyltransferase  48.11 
 
 
714 aa  635  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136418  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2591  phosphate acetyltransferase  47.64 
 
 
714 aa  633  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000450419  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02182  hypothetical protein  47.64 
 
 
714 aa  633  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0211624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2477  phosphate acetyltransferase  47.41 
 
 
715 aa  634  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1355  phosphate acetyltransferase  47.64 
 
 
714 aa  633  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00139593  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2453  phosphate acetyltransferase  48.11 
 
 
714 aa  635  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434183  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2447  phosphate acetyltransferase  47.64 
 
 
714 aa  633  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000498187  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2887  phosphate acetyltransferase  47.39 
 
 
713 aa  626  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000745761  decreased coverage  0.0000011303 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1668  phosphate acetyltransferase  47.33 
 
 
715 aa  627  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000363835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2394  phosphate acetyltransferase  47.11 
 
 
712 aa  627  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00114366  normal  0.608278 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02943  phosphate acetyltransferase  46.71 
 
 
716 aa  627  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2694  phosphate acetyltransferase  46.84 
 
 
717 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000035101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2382  phosphate acetyltransferase  46.65 
 
 
717 aa  624  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000517206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2773  phosphate acetyltransferase  46.84 
 
 
717 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000126217  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2675  phosphate acetyltransferase  46.84 
 
 
717 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000376999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1690  phosphate acetyltransferase  46.84 
 
 
717 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000858344  normal  0.0172468 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2310  phosphate acetyltransferase  49.78 
 
 
699 aa  620  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0880  phosphate acetyltransferase  47.99 
 
 
699 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41130  phosphate acetyltransferase  52.1 
 
 
691 aa  619  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735212  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1551  phosphate acetyltransferase  46.42 
 
 
717 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0542172  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1704  phosphate acetyltransferase  46.71 
 
 
713 aa  619  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000601428  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1826  phosphate acetyltransferase  48.12 
 
 
691 aa  616  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2916  phosphate acetyltransferase  46.56 
 
 
717 aa  617  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1490  phosphate acetyltransferase  46.84 
 
 
717 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000130652  normal  0.921429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2591  phosphate acetyltransferase  47.54 
 
 
714 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.171095  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1557  phosphate acetyltransferase  46.7 
 
 
717 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.243482  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1494  phosphate acetyltransferase  46.69 
 
 
712 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000825995  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0345  phosphate acetyltransferase  47.48 
 
 
715 aa  606  9.999999999999999e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00951543  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3177  phosphate acetyltransferase  47.91 
 
 
706 aa  605  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0503122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4415  phosphate acetyltransferase  46.97 
 
 
695 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259249  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0216  phosphate acetyltransferase  48.11 
 
 
718 aa  596  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0799  phosphate acetyltransferase  47.63 
 
 
695 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.148954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3540  phosphate acetyltransferase  46.49 
 
 
712 aa  597  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0813  phosphate acetyltransferase  47.34 
 
 
695 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0196  phosphate acetyltransferase  47.55 
 
 
718 aa  590  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.027036 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2896  phosphate acetyltransferase  48.73 
 
 
714 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0774  phosphate acetyltransferase  47.77 
 
 
695 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81433  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3100  phosphate acetyltransferase  47.65 
 
 
711 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3087  phosphate acetyltransferase  48.73 
 
 
714 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2982  phosphate acetyltransferase  48.59 
 
 
714 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02237  phosphate acetyltransferase  45.35 
 
 
692 aa  570  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0383  phosphate acetyltransferase  41.23 
 
 
711 aa  534  1e-150  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1378  phosphotransacetylase  79.01 
 
 
588 aa  514  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.926541  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0857  phosphate acetyltransferase  47.59 
 
 
699 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.816812  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  38.92 
 
 
700 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  37.52 
 
 
701 aa  439  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  40.2 
 
 
703 aa  435  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  40.45 
 
 
695 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  37.43 
 
 
698 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  36.88 
 
 
702 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0205  phosphate acetyltransferase  40.03 
 
 
707 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0580706  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  40.6 
 
 
689 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1871  phosphate acetyltransferase  37.02 
 
 
691 aa  416  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  36.01 
 
 
707 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3241  phosphate acetyltransferase  37.3 
 
 
719 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0537  phosphate acetyltransferase  39.81 
 
 
704 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0527  phosphate acetyltransferase  39.81 
 
 
704 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  36.86 
 
 
702 aa  418  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0549  phosphate acetyltransferase  39.81 
 
 
704 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  37.13 
 
 
704 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01780  phosphate acetyltransferase  39.89 
 
 
691 aa  419  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  37.78 
 
 
704 aa  416  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  35.72 
 
 
707 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0700  phosphate acetyltransferase  39.48 
 
 
692 aa  415  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0266359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>