12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1748 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2243  nitrous oxidase accessory protein  74.29 
 
 		 455 aa  671    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.685019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3544  parallel beta-helix repeat-containing protein  76.71 
 
 		 451 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.502732  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1748  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 454 aa  894    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1920  twin-arginine translocation pathway signal  73.13 
 
 		 450 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2646  nitrous oxidase accessory protein  75.38 
 
 		 455 aa  677    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3016  hypothetical protein  72.35 
 
 		 458 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.399987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2030  hypothetical protein  73.57 
 
 		 452 aa  653    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.789621  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0795  hypothetical protein  43.93 
 
 		 456 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0908  hypothetical protein  41.67 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0731349  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2472  hypothetical protein  29.27 
 
 		 503 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  26.98 
 
 		 709 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.25 
 
 		 644 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>