19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1487 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1487  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1039    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4453  hypothetical protein  63.24 
 
 		 535 aa  639    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1669  hypothetical protein  61.58 
 
 		 535 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3815  hypothetical protein  61.21 
 
 		 535 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.108699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1101  hypothetical protein  47.82 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.322758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  38.06 
 
 		 497 aa  276  8e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1333  hypothetical protein  48.75 
 
 		 587 aa  272  9e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5535  hypothetical protein  43.32 
 
 		 623 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5545  hypothetical protein  33.27 
 
 		 532 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2015  hypothetical protein  34.78 
 
 		 587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0952  hypothetical protein  37.14 
 
 		 597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0915  hypothetical protein  37.14 
 
 		 597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342242  normal  0.94369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2312  hypothetical protein  36 
 
 		 599 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4186  hypothetical protein  37.99 
 
 		 602 aa  118  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7240  hypothetical protein  31.36 
 
 		 588 aa  113  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.510618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0891  hypothetical protein  35.84 
 
 		 597 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 		 344 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0044  flagellar hook-associated protein FlgL  39.24 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2698  putative flagellar hook-associated protein  23.78 
 
 		 339 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>