More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4086 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 
293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  82.25 
 
 
293 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  66.09 
 
 
294 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4203  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  62.2 
 
 
294 aa  343  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.852389  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2918  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  68.57 
 
 
294 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3860  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  61.9 
 
 
293 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  56.36 
 
 
293 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  55.71 
 
 
300 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  53.24 
 
 
294 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  53.5 
 
 
290 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2876  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.07 
 
 
286 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1343  phosphonate ABC transporter permease  36.07 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0495626 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2797  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3707  phosphonate ABC transporter permease  37.87 
 
 
292 aa  178  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.324444 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4785  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
280 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161487  normal  0.0587654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
277 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
277 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.49 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  45.5 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1321  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.17 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0282  ABC transporter membrane spanning protein (phosphonate)  34.32 
 
 
320 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2681  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.42 
 
 
288 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0896  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.92 
 
 
295 aa  161  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4666  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.92 
 
 
320 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00096025 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2284  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.19 
 
 
266 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0852833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1319  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.97 
 
 
287 aa  158  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758207  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.1 
 
 
263 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  41.55 
 
 
259 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 
271 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 
271 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 
271 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  42.08 
 
 
272 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  42.08 
 
 
259 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 
271 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 
271 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.08 
 
 
259 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 
271 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  42.08 
 
 
259 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 
271 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  42.08 
 
 
259 aa  155  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.8 
 
 
259 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.15 
 
 
280 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2675  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.82 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0563966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.72 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.72 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.1 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.46 
 
 
266 aa  153  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.75 
 
 
266 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2184  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.86 
 
 
290 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.122688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  40.21 
 
 
264 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1412  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.46 
 
 
287 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  40.21 
 
 
264 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  39.62 
 
 
365 aa  152  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  40.21 
 
 
264 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.21 
 
 
264 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.38 
 
 
276 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4429  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.35 
 
 
319 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  40.21 
 
 
264 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0132  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 
266 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0127  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 
266 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3370  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.79 
 
 
267 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3743  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.27 
 
 
267 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000033324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3472  phosphonate ABC transporter permease  44.27 
 
 
267 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3438  phosphonate ABC transporter, permease  44.27 
 
 
267 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.573649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3389  phosphonate ABC transporter, permease  44.27 
 
 
267 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00227176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3747  phosphonate ABC transporter permease  44.27 
 
 
267 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.375049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3701  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.27 
 
 
267 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  36.73 
 
 
280 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.21 
 
 
264 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.69 
 
 
264 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.69 
 
 
264 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  38.89 
 
 
275 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1523  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.27 
 
 
267 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137606  normal  0.0137345 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3792  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.27 
 
 
267 aa  149  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3720  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.27 
 
 
267 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0181873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  42.11 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.59 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  42.11 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2337  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.79 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000326587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  41.33 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.69 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.18 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.92 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0131  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  39.9 
 
 
289 aa  145  9e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0113761  hitchhiker  0.00000772966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4115  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.12 
 
 
319 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.8 
 
 
271 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2202  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  38.79 
 
 
542 aa  142  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0827  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.59 
 
 
267 aa  142  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.18 
 
 
265 aa  142  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2297  ABC phosphonate permease  40.4 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.69 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.05 
 
 
533 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.69 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  43.39 
 
 
267 aa  139  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4179  phosphonate ABC transporter permease  43.48 
 
 
288 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  37.93 
 
 
261 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  37.93 
 
 
261 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2081  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  37.69 
 
 
335 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2674  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.09 
 
 
266 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>