19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3974 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3974  photosynthetic complex assembly protein  100 
 
 		 220 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728012  normal  0.262812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3729  putative photosynthetic complex assembly protein  86.36 
 
 		 220 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00156993  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1737  putative photosynthetic complex assembly protein  76.36 
 
 		 220 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1320  photosynthetic complex assembly protein  60.91 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562837  normal  0.156317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0616  photosynthetic complex assembly protein  43.43 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6410  hypothetical protein  44.12 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2035  photosynthetic complex assembly protein  44.13 
 
 		 232 aa  158  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4809  putative photosynthetic complex assembly protein  42.52 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799721 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1630  hypothetical protein  39.78 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5354  putative photosynthetic complex assembly protein  44.1 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.457563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5276  putative photosynthetic complex assembly protein  41.12 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1841  putative photosynthetic complex assembly protein  46.43 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0719719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0154  photosynthetic complex assembly protein  39.34 
 
 		 216 aa  134  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1935  hypothetical protein  38.5 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1003  hypothetical protein  37.56 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0292  hypothetical protein  37.24 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3725  putative photosynthetic complex assembly protein  42.86 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3541  putative photosynthetic complex assembly protein  35.87 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  32.2 
 
 		 170 aa  42  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>