15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1245 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1245  late embryogenesis abundant protein  100 
 
 		 407 aa  786    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3871  late embryogenesis abundant protein  84.77 
 
 		 407 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.396289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1436  hypothetical protein  63.81 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.050652  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4601  late embryogenesis abundant protein  47.97 
 
 		 405 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3876  hypothetical protein  35.56 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.300055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4598  hypothetical protein  33.74 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1439  hypothetical protein  32.97 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21611  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1044  hypothetical protein  27.2 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3868  hypothetical protein  26.86 
 
 		 232 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.407065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2382  hypothetical protein  27.2 
 
 		 369 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374841  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1248  hypothetical protein  31.18 
 
 		 241 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34590  hypothetical protein  30.07 
 
 		 268 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.911708  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1592  hypothetical protein  30.68 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2258  hypothetical protein  31.09 
 
 		 275 aa  47.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601057  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1892  hypothetical protein  24.29 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.664815  normal  0.748822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>