11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1851 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1851  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482991  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2041  hypothetical protein  91.01 
 
 		 267 aa  510  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1720  hypothetical protein  64.04 
 
 		 263 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1436  hypothetical protein  61.51 
 
 		 262 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563659  normal  0.0403668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3593  hypothetical protein  59.23 
 
 		 259 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42780  hypothetical protein  58.85 
 
 		 259 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3882  hypothetical protein  59.25 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0219441  normal  0.242348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1828  hypothetical protein  58.87 
 
 		 260 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1406  hypothetical protein  61.16 
 
 		 260 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1880  hypothetical protein  51.87 
 
 		 268 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150791  normal  0.563397 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4676  hypothetical protein  26.97 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>