16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1137 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1137  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.290114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1320  hypothetical protein  88.05 
 
 		 250 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4657  hypothetical protein  66.14 
 
 		 249 aa  338  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1262  protein of unknown function UPF0153  60.24 
 
 		 254 aa  311  6.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0800  hypothetical protein  56.38 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0824  hypothetical protein  55.97 
 
 		 244 aa  287  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131616  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4386  hypothetical protein  56.38 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0839  hypothetical protein  55.14 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1855  hypothetical protein  39.59 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5497  protein of unknown function UPF0153  38.62 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.30539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5135  protein of unknown function UPF0153  36.75 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3943  hypothetical protein  33.89 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4406  hypothetical protein  34.73 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6825  hypothetical protein  41.15 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4987  hypothetical protein  36.54 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  26.09 
 
 		 444 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>