34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1880 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1880  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  347  4e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1771  cell division protein ZapA  55.56 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0377229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2053  hypothetical protein  48.24 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.411502 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  32.43 
 
 		 99 aa  51.6  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  35.09 
 
 		 102 aa  48.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  45.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0845  hypothetical protein  30.16 
 
 		 99 aa  45.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.062797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0963  hypothetical protein  30.16 
 
 		 99 aa  45.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  25.29 
 
 		 106 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  39.29 
 
 		 99 aa  44.3  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  27.08 
 
 		 104 aa  44.3  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  31.88 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2540  putative cell division protein ZapA  29.63 
 
 		 113 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  29.51 
 
 		 100 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02381  hypothetical protein  24.72 
 
 		 99 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  24.14 
 
 		 106 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3592  Z-ring-associated protein  26.74 
 
 		 109 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  24.14 
 
 		 106 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0897  protein of unknown function DUF710  29.51 
 
 		 101 aa  42.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  23.53 
 
 		 105 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  24.14 
 
 		 106 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3921  Z-ring-associated protein  27.91 
 
 		 109 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000155243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5437  cell division protein ZapA  25 
 
 		 105 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3473  Z-ring-associated protein  25.58 
 
 		 109 aa  41.6  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4772  hypothetical protein  30.36 
 
 		 126 aa  42  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.842395  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4704  hypothetical protein  37.04 
 
 		 100 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  27.27 
 
 		 127 aa  41.2  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  27.27 
 
 		 102 aa  41.6  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  30.43 
 
 		 102 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5970  hypothetical protein  25.81 
 
 		 104 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69030  hypothetical protein  25.81 
 
 		 104 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4888  hypothetical protein  36.62 
 
 		 100 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.369158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3280  protein of unknown function DUF710  24.44 
 
 		 98 aa  40.8  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0411428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0446  Z-ring-associated protein  26.74 
 
 		 109 aa  40.8  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00725856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>