More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0670 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  100 
 
 		 393 aa  814    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0714  globin  70.68 
 
 		 399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.757687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  45.23 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  44.39 
 
 		 402 aa  299  6e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  42.68 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  42.2 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  41.22 
 
 		 402 aa  290  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  41.71 
 
 		 402 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  41.95 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  41.95 
 
 		 402 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  41.95 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  41.71 
 
 		 402 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  41.71 
 
 		 402 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  41.71 
 
 		 402 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  40.89 
 
 		 400 aa  282  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0230  globin  38.93 
 
 		 381 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0224  globin  38.93 
 
 		 381 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0325  flavohemoprotein, putative  40.3 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.29 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  37.5 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  38.92 
 
 		 396 aa  264  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  38.29 
 
 		 400 aa  262  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.17 
 
 		 402 aa  259  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  38.81 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  38.17 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  38.17 
 
 		 402 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  36.41 
 
 		 396 aa  253  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  37.66 
 
 		 402 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  37.91 
 
 		 402 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  37.66 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  37.66 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.66 
 
 		 402 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  37.14 
 
 		 396 aa  249  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  38.33 
 
 		 396 aa  249  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.91 
 
 		 402 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.18 
 
 		 428 aa  249  7e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  37.91 
 
 		 402 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  37.16 
 
 		 396 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  38.17 
 
 		 402 aa  249  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  37.16 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  37.16 
 
 		 396 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  37.16 
 
 		 396 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  37.4 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  37.65 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  37.4 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  37.4 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  37.4 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  37.16 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  37.16 
 
 		 397 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  36.05 
 
 		 426 aa  246  6.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  36.27 
 
 		 397 aa  245  8e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  35.8 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  36.03 
 
 		 397 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  36.92 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  37.87 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.5 
 
 		 403 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  36.92 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  35.78 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  36.67 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.67 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  36.67 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  36.67 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  36.67 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  37.01 
 
 		 403 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  36.67 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  36.67 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  36.67 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  36.67 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  39.71 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  36.43 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  35.06 
 
 		 394 aa  240  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.62 
 
 		 403 aa  239  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  39.08 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  39.76 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  35.87 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  34.72 
 
 		 394 aa  236  7e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  37.5 
 
 		 393 aa  235  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  34.4 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  34.4 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  34.4 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  37.75 
 
 		 392 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1079  nitric oxide dioxygenase  39 
 
 		 408 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  37.5 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  37.47 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  38.54 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  35.94 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  34.73 
 
 		 396 aa  230  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0832  nitric oxide dioxygenase  37.5 
 
 		 392 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  34.32 
 
 		 396 aa  230  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  37.5 
 
 		 401 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  36.65 
 
 		 409 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07160  response to stress-related protein, putative  36.56 
 
 		 504 aa  228  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  35.73 
 
 		 409 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4378  nitric oxide dioxygenase  37.99 
 
 		 392 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.25 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  37.02 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  35.94 
 
 		 414 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  35.87 
 
 		 410 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  37.41 
 
 		 393 aa  226  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  34.81 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>