34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3020 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3020  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  297  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2733  hypothetical protein  93.24 
 
 		 162 aa  224  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0770858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3176  hypothetical protein  64.15 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4742  hypothetical protein  47.79 
 
 		 163 aa  94  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.593636  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1115  hypothetical protein  46.84 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1065  hypothetical protein  49.68 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0955  hypothetical protein  48.1 
 
 		 169 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0125  hypothetical protein  39.62 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3030  hypothetical protein  35.67 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0565079  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2435  hypothetical protein  36.31 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1834  hypothetical protein  34.87 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01680  hypothetical protein  28.22 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1171  hypothetical protein  34.36 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1172  hypothetical protein  35.58 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2771  hypothetical protein  34.62 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403966  normal  0.41413 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3378  hypothetical protein  31.14 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2330  hypothetical protein  39.38 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.100797  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1242  hypothetical protein  34.36 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.976813  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0871  membrane protein  30.32 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.607811  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1372  hypothetical protein  32.35 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4069  hypothetical protein  31.58 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0817  hypothetical protein  36.54 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1315  hypothetical protein  36.75 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.749821  normal  0.330584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3205  hypothetical protein  35.9 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.824686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3062  hypothetical protein  36.28 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3048  hypothetical protein  36.28 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1004  hypothetical protein  29.81 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2708  hypothetical protein  38.04 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.240374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2465  hypothetical protein  35.44 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1485  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0459  hypothetical protein  40.3 
 
 		 160 aa  44.3  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5848  hypothetical protein  30.41 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6579  hypothetical protein  31.25 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1488  hypothetical protein  30.57 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>