14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2795 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2795  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.150416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2895  hypothetical protein  95.79 
 
 
214 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2887  hypothetical protein  92.99 
 
 
214 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0248177  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2398  hypothetical protein  81.37 
 
 
218 aa  351  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.54266  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1737  hypothetical protein  61.62 
 
 
222 aa  261  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4256  hypothetical protein  63.39 
 
 
230 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915511 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4782  hypothetical protein  62.84 
 
 
230 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181394  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2045  hypothetical protein  62.16 
 
 
222 aa  254  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0577  hypothetical protein  60.11 
 
 
209 aa  244  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1919  hypothetical protein  28.49 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2905  alpha amylase domain-containing protein  26.16 
 
 
185 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.450058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2130  hypothetical protein  28.98 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00274395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1924  hypothetical protein  28.86 
 
 
435 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0361  hypothetical protein  27.07 
 
 
195 aa  49.3  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.793199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>