55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2276 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2276  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3495  hypothetical protein  98.69 
 
 		 230 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.84074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2433  hypothetical protein  94.32 
 
 		 251 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2868  hypothetical protein  79.57 
 
 		 231 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.505053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2390  hypothetical protein  68.7 
 
 		 231 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.351246  hitchhiker  0.000408238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4779  hypothetical protein  65.22 
 
 		 231 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4328  hypothetical protein  65.65 
 
 		 233 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1228  hypothetical protein  45.37 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0746  hypothetical protein  45.02 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1203  hypothetical protein  43.4 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4424  hypothetical protein  45.97 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4370  hypothetical protein  45.5 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00679884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4040  hypothetical protein  45.02 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000619844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4312  hypothetical protein  45.02 
 
 		 235 aa  184  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95415e-51 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4407  hypothetical protein  45.02 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1173  SAM-dependent methyltransferase  50.25 
 
 		 229 aa  184  8e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0722958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4513  hypothetical protein  45.02 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000472419  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4030  hypothetical protein  45.02 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000059354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4192  hypothetical protein  45.02 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00200706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4142  hypothetical protein  45.02 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000128061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3017  hypothetical protein  44.08 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0496127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2411  protein of unknown function DUF633  45.54 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00449661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0829  hypothetical protein  44.08 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000387788  hitchhiker  1.2637100000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0770  SAM-dependent methyltransferase  43.2 
 
 		 229 aa  174  9e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0160  protein of unknown function DUF633  44.93 
 
 		 234 aa  174  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1111  SAM-dependent methyltransferase  36.24 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0101071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1126  hypothetical protein  40.84 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000295652  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1652  hypothetical protein  41.88 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1618  hypothetical protein  41.88 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0130761  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2460  hypothetical protein  35.11 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1316  hypothetical protein  38.42 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00516293  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0997  SAM-dependent methyltransferase  33.84 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3035  protein of unknown function DUF633  40 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0543  protein of unknown function DUF633  34.44 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000632736  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1973  hypothetical protein  27.95 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0572365  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2262  hypothetical protein  28.26 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4215  protein of unknown function DUF633  39.04 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866297  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0502  hypothetical protein  32.93 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00991935  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3520  hypothetical protein  32.24 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0625  hypothetical protein  38.42 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.155945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0645  hypothetical protein  27.07 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000274924  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0496  hypothetical protein  34.34 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000915457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1620  protein of unknown function DUF633  27.09 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.282895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0893  hypothetical protein  34.03 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000579541  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0102  hypothetical protein  34.98 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0357  hypothetical protein  31.45 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.298514  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl271  putative SAM-dependent methyltransferase  28.49 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0014027  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0009  hypothetical protein  32.14 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.400013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1216  protein of unknown function DUF633  23.58 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000079225  hitchhiker  0.00246839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1975  protein of unknown function DUF633  35.48 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1134  protein of unknown function DUF633  23.62 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000709417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1400  hypothetical protein  28.75 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2668  hypothetical protein  27.27 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.37 
 
 		 316 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1811  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  20.81 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>