24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1861 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1861  peptidase  100 
 
 		 90 aa  183  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.746884  normal  0.0400575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2974  peptidase  85.56 
 
 		 90 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.577103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2589  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0869265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2565  hypothetical protein  41.67 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84434  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1783  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0218342  normal  0.0624133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3074  hypothetical protein  43.68 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1313  hypothetical protein  43.18 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1643  hypothetical protein  39.73 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3763  hypothetical protein  54.17 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0640  hypothetical protein  33.75 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.377237  normal  0.24293 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3781  hypothetical protein  39.66 
 
 		 211 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0651  hypothetical protein  32.93 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.248101  normal  0.0865626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1899  hypothetical protein  27.59 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494272  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0619  hypothetical protein  40.82 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.669584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2198  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0783  hypothetical protein  36.76 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.143696  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1863  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1625  hypothetical protein  36.76 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.045031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0672  hypothetical protein  36.76 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440129  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0560  hypothetical protein  36.76 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2075  hypothetical protein  36.76 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  42.86 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1042  hypothetical protein  26.74 
 
 		 203 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3141  hypothetical protein  40.98 
 
 		 86 aa  40  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>