17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0552 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0552  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 269 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.213682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0540  Cro/CI family transcriptional regulator  95.17 
 
 		 269 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0497  Cro/CI family transcriptional regulator  94.8 
 
 		 269 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0531  Cro/CI family transcriptional regulator  94.42 
 
 		 269 aa  500  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35470  hypothetical protein  78.68 
 
 		 272 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.030822  hitchhiker  0.00555849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2990  hypothetical protein  78.31 
 
 		 272 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0134  helix-turn-helix domain-containing protein  73.9 
 
 		 272 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0788  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2650  transcriptional regulator  46.09 
 
 		 271 aa  218  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00061055  normal  0.037615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0390  hypothetical protein  33.59 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2182  putative transcriptional regulator  34.35 
 
 		 264 aa  128  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293373  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4501  helix-turn-helix domain protein  31.72 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0769508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6961  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.512084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6303  hypothetical protein  31.1 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.519477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1526  hypothetical protein  31.1 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.818031  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1093  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 280 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0872  XRE family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.336664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>