13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4814 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4814  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0662  hypothetical protein  51.05 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2165  hypothetical protein  26.84 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3156  hypothetical protein  29.87 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5212  hypothetical protein  29.87 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5062  hypothetical protein  29.87 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1471  hypothetical protein  25.71 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0937  hypothetical protein  25.8 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4249  hypothetical protein  26.24 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000156109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2210  hypothetical protein  25.73 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  35.29 
 
 		 2272 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.27 
 
 		 2449 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  33.75 
 
 		 3409 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>