12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4249 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4249  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  513  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000156109 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6140  hypothetical protein  40.48 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2313  hypothetical protein  29.6 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3156  hypothetical protein  30.47 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5212  hypothetical protein  30.47 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5062  hypothetical protein  30.47 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0662  hypothetical protein  30.13 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2165  hypothetical protein  26.74 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0937  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4814  hypothetical protein  26.24 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1471  hypothetical protein  28.24 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2210  hypothetical protein  25.3 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>