10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2165 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2165  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3156  hypothetical protein  29.67 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5212  hypothetical protein  29.67 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5062  hypothetical protein  29.67 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0662  hypothetical protein  36.46 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1471  hypothetical protein  29.1 
 
 		 293 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0937  hypothetical protein  27.61 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4814  hypothetical protein  30.29 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2210  hypothetical protein  27.68 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4249  hypothetical protein  27.64 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000156109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>