12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3156 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3156  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5212  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5062  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2165  hypothetical protein  29.67 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4814  hypothetical protein  30 
 
 
314 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0662  hypothetical protein  29.66 
 
 
281 aa  96.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1471  hypothetical protein  30.87 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0937  hypothetical protein  30.72 
 
 
294 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2210  hypothetical protein  27.76 
 
 
295 aa  85.9  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4249  hypothetical protein  29.65 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000156109 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2313  hypothetical protein  25.37 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6140  hypothetical protein  29.71 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>