96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4091 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4091  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  100 
 
 		 311 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4570  hypothetical protein  97.43 
 
 		 311 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1319  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  97.43 
 
 		 311 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3870  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  94.21 
 
 		 311 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1584  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  85.21 
 
 		 312 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158822  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3901  hypothetical protein  85.53 
 
 		 312 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1414  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  86.17 
 
 		 312 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4574  hypothetical protein  76.21 
 
 		 312 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0566629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52150  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO2  76.53 
 
 		 312 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0295092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5679  putative aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  54.97 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3460  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  58.8 
 
 		 304 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3524  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  58.43 
 
 		 304 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196808  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1756  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  52.33 
 
 		 300 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2078  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  51.67 
 
 		 300 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3377  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  56.55 
 
 		 304 aa  315  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3498  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  52.19 
 
 		 299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3981  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  51.85 
 
 		 299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1877  putative aspartyl/asparaginyl BETA-hydroxylase transmembrane protein  50.33 
 
 		 300 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0347  hypothetical protein  51.18 
 
 		 299 aa  311  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119011  hitchhiker  0.000140688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4088  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  50.84 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3435  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  50.84 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2463  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  51.58 
 
 		 300 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4278  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  50.84 
 
 		 299 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309505  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2325  hypothetical protein  58.53 
 
 		 300 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4498  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  49.33 
 
 		 299 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0866  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  49.82 
 
 		 300 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3964  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  52.28 
 
 		 298 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0568  hypothetical protein  50.17 
 
 		 299 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474129  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1865  hypothetical protein  50.17 
 
 		 299 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1928  beta-hydroxylase  50.17 
 
 		 299 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.101545  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0898  hypothetical protein  50.17 
 
 		 299 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.838267  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2021  beta-hydroxylase  50.17 
 
 		 315 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0446  hypothetical protein  50.17 
 
 		 299 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51640  Lipopolysaccharide biosynthetic protein  53.88 
 
 		 299 aa  295  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.664439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2921  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  48.48 
 
 		 316 aa  295  8e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58550  lipopolysaccharide biosynthetic protein LpxO1  50.83 
 
 		 299 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2063  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  49.5 
 
 		 299 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3272  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  53.85 
 
 		 299 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3770  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  49.5 
 
 		 302 aa  289  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.856849 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4632  membrane-bound beta-hydroxylase  54.62 
 
 		 302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4632  membrane-bound beta-hydroxylase  54.62 
 
 		 302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4681  membrane-bound beta-hydroxylase  54.62 
 
 		 302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4541  membrane-bound beta-hydroxylase  54.62 
 
 		 302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4548  beta-hydroxylase, aspartyl/asparaginyl family  54.62 
 
 		 302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5126  hypothetical protein  50.17 
 
 		 299 aa  288  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2423  hypothetical protein  50.17 
 
 		 299 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.695409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03631  aspartyl-asparaginyl beta-hydroxylase  50.7 
 
 		 301 aa  287  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2028  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  43.97 
 
 		 304 aa  286  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3076  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  53.85 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2612  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  50.18 
 
 		 299 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2054  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  52.17 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332449  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0925  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  52.31 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.60975  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0821  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  52.31 
 
 		 301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44380  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase family protein  36.56 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238652  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2383  hypothetical protein  31.18 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2982  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase  35.42 
 
 		 248 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2530  hypothetical protein  31.18 
 
 		 239 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1730  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.68 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1613  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.21 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44410  Aspartyl/Asparaginyl beta-hydroxylase family protein  31.9 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0878318  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1078  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  28.27 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5116  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.28 
 
 		 229 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5163  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.28 
 
 		 229 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.784286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3204  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.28 
 
 		 229 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3492  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  33.33 
 
 		 229 aa  95.9  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.405318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0466  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.96 
 
 		 229 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3198  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.78 
 
 		 228 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.966263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0896  beta-hydroxylase  32 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2019  beta-hydroxylase  32 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1927  beta-hydroxylase  32 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0571  hypothetical protein  32 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5084  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.26 
 
 		 229 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4559  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  32.26 
 
 		 229 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  normal  0.524897 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1863  beta-hydroxylase  32 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0445  asparaginyl beta-hydroxylase  32 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3497  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.53 
 
 		 276 aa  92.8  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5085  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  31.19 
 
 		 256 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193259  normal  0.545985 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0971  asparaginyl beta-hydroxylase  30.86 
 
 		 334 aa  86.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.916669  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0306  hypothetical protein  30.54 
 
 		 252 aa  85.9  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.497048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2038  hypothetical protein  28.14 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3143  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.75 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1816  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.23 
 
 		 388 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3011  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  27.14 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1745  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  46.77 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3665  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  26.23 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44132  predicted protein  27.12 
 
 		 386 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0240855  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3668  Peptide-aspartate beta-dioxygenase  25.7 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406515  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44505  predicted protein  33.03 
 
 		 521 aa  52.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3110  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  25.27 
 
 		 399 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46074  predicted protein  27.42 
 
 		 380 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4194  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.97 
 
 		 199 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0165  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.97 
 
 		 199 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.187891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0161  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  30.97 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46818  predicted protein  28.95 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0179  hypothetical protein  30.56 
 
 		 192 aa  43.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19091  hypothetical protein  30.56 
 
 		 292 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0440547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>