19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4065 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4065  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 122 aa  243  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4558  acetyltransferase  89.34 
 
 		 146 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1331  GCN5-related N-acetyltransferase  87.7 
 
 		 146 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3858  GCN5-related N-acetyltransferase  70.49 
 
 		 149 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3779  GCN5-related N-acetyltransferase  58.88 
 
 		 148 aa  120  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.72634  normal  0.0513749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1599  acetyltransferase, GNAT family  57.94 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.693259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4348  GCN5-related N-acetyltransferase  53.77 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3184  GCN5-related N-acetyltransferase  57.94 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.056903  normal  0.102185 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3913  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04402  acetyltransferase  47.17 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  28.71 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000885364  hitchhiker  0.000586382 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0989  acetyltransferase  41.51 
 
 		 166 aa  42.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2798  acetyltransferase  36.84 
 
 		 267 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.097578  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0491  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1265  GCN5-related N-acetyltransferase  29.35 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000595975  hitchhiker  0.00335305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0645  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0202346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  35.63 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1379  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>